Uniwersytet Opolski - Centralny System Uwierzytelniania
Strona główna

Metody badań skamieniałości

Informacje ogólne

Kod przedmiotu: 6.18-MBS
Kod Erasmus / ISCED: (brak danych) / (brak danych)
Nazwa przedmiotu: Metody badań skamieniałości
Jednostka: Wydział Przyrodniczo-Techniczny
Grupy:
Punkty ECTS i inne: (brak) Podstawowe informacje o zasadach przyporządkowania punktów ECTS:
  • roczny wymiar godzinowy nakładu pracy studenta konieczny do osiągnięcia zakładanych efektów uczenia się dla danego etapu studiów wynosi 1500-1800 h, co odpowiada 60 ECTS;
  • tygodniowy wymiar godzinowy nakładu pracy studenta wynosi 45 h;
  • 1 punkt ECTS odpowiada 25-30 godzinom pracy studenta potrzebnej do osiągnięcia zakładanych efektów uczenia się;
  • tygodniowy nakład pracy studenta konieczny do osiągnięcia zakładanych efektów uczenia się pozwala uzyskać 1,5 ECTS;
  • nakład pracy potrzebny do zaliczenia przedmiotu, któremu przypisano 3 ECTS, stanowi 10% semestralnego obciążenia studenta.

zobacz reguły punktacji
Język prowadzenia: (brak danych)
Skrócony opis:

(1) Rozumienie wybranych zagadnień dotyczących teorii i praktyki nazewnictwa i klasyfikowania biologicznego, oraz zasad podziału organizmów żywych.

(2) Poznanie i zrozumienie pojęć z zakresu klasyfikacji organizmów; poznanie metod rekonstrukcji filogenezy. Umiejętność wartościowania i analizy cech użytych do tworzenia hipotez filogenetycznych. Zrozumienie metod filogenetyki klasycznej i molekularnej. Umiejętność wykorzystania technik komputerowych oraz danych internetowych w procesie rekonstrukcji filogenezy. Umiejętność prezentacji pracy semestralnej w postaci pokazu multimedialnego.

(3) Nabycie wiedzy o nowoczesnej aparaturze badawczej, jej możliwościach i zastosowaniach w naukach przyrodniczych. Umiejętność pracy w grupie.

Pełny opis:

Problematyka wykładu:

(1) Rola i zadania systematyki (taksonomii). Systematyka jako dziedzina nauk przyrodniczych. Historia powstania obecnej klasyfikacji organizmów. Zasady i stosowanie nomenklatury botanicznej i zoologicznej. Źródła danych i sposoby ich interpretacji w taksonomii. Metodyka badań taksonomicznych. Analiza filogenetyczna jako podstawa do tworzenia klasyfikacji. Podstawy systematyki fenetycznej, kladystycznej i ewolucyjnej. Taksonomia molekularna

(2) Taksonomia i jej typy: klasyczna, fenetyczna, ewolucyjna, filogenetyczna i molekularna. Cechy w klasyfikacji, homologia i homoplazja; znaczenie tych zjawisk dla tworzenia klasyfikacji i rekonstrukcji filogenezy. Zastosowanie metod klasycznych i molekularnych w analizach filogenetycznych. Techniki analiz filogenetycznych – algorytmy, kryteria, tworzenie drzew oraz ich testowanie. Zastosowanie technik komputerowych do rekonstrukcji filogenezy. Wykorzystanie banków danych genetycznych w procesie rekonstrukcji filogenezy. Zegar molekularny i dane kopalne w rekonstrukcji filogenezy. Analizy filogenetyczne w oparciu o dane morfologiczne i molekularne na wybranych przykładach.

(3) Mikroskopia świetlna i elektronowa, katodoluminescencja, mikrosondy, rentgenografia (XRD, XRF, tomografia), ultrafiolet, podczerwień, magnetyczny rezonans jądrowy, geochemia izotopów.

Problematyka ćwiczeń laboratoryjnych: praktyczne zapoznanie się z aparaturą, analiza wyników

Literatura:

A. Literatura wymagana do ostatecznego zaliczenia zajęć:

Futuyma, D. J.: Drzewo życia: klasyfikacja i filogeneza, str. 17-41, W: Ewolucja, Wydawnictwo UW, 2009.

Matile L., Tassay P., Goujet D.: Wstęp do systematyki zoologicznej. PWN, Warszawa 1993,

Spalik, K., M. Piwczyński: Rekonstrukcja filogenezy i wnioskowanie filogenetyczne w badaniach ewolucyjnych, Kosmos,

58(3/4): 485-498, 2009.

Stace C. A.: Taksonomia roslin i biosystematyka. PWN, Warszawa 1993.

Matile L., Tassy P., Goujet D. Wstęp do systematyki zoologicznej – koncepcje, zasady, metody. Wyd. Nauk. PWN,1993. Xiong J. Podstawy bioinformatyki. Wyd. UW, 2009 (przekład red. nauk. Bujnicki J.)

Wägele J.-W. Foundations of Phylogenetic Systematics. Verlag Dr. Friedrich Pfeil, München, 2005.

Pilot M., Rutkowski R. Zastosowanie metod molekularnych w badaniach ekologicznych. Muzeum i Instytut Zoologii PAN, Warszawa 2005.

Brown T.A. Genomy. Wyd. Nauk. PWN, Warszawa, 2009.

-literatura fachowa (publikacje) w języku polskim i angielskim.

Artykuły naukowe z zakresu zastosowania omawianych metod fizyko-chemicznych

B. Literatura uzupełniająca

Higgs P.G., Attwood T.K. Bioinformatyka i ewolucja molekularna. Wyd. Nauk. PWN, Warszawa, 2008.

Wheeler Q.D. (ed.). The New Taxonomy. CRC Press, Boca Raton – London – New York, 2008.

Freeland J.R. Ekologia molekularna. Wydawnictwo Naukowe PWN, Warszawa, 2008.

Słomski R. (red.). Przykłady analiz DNA. Wydawnictwo AR w Poznaniu, Poznań, 2004.

literatura fachowa (publikacje) w języku polskim i angielskim.

Efekty uczenia się:

Wiedza

SD_W02_ opisuje wyspecjalizowane zagadnienia z zakresu biologii, bioinformatyki i ekologii

SD_W03_dyskutuje na temat bieżących problemów naukowych z zakresu nauk biologicznych oraz ich powiązań z naukami ścisłymi i technicznymi.

SD_W04_ charakteryzuje nowoczesną metodologię i warsztat badawczy uprawianej dyscypliny

SD_W05_posługuje się specjalistyczną terminologią w języku ojczystym i kongresowym

Umiejętności

SD_U01_formułuje hipotezy badawcze i weryfikuje je za pomocą odpowiednio dobranych metod obliczeniowych

SD_U03_wykorzystuje i analizuje różnorodne źródła specjalistycznej informacji, w tym bioinformatyczne

Kompetencje społeczne (postawy)

SD_K01_ dzieli się zdobytymi doświadczeniami w pracy naukowej i dydaktycznej

SD_K02_krytycznie ocenia wyniki własnych badań i innych autorów

Metody i kryteria oceniania:

Sposób zaliczenia

• wykład: egzamin/kolokwium

• laboratorium: zaliczenie z oceną

Formy zaliczenia

• wykład: zaliczenie w formie pisemnego testu (test wyboru oraz z pytaniami otwartymi)

• laboratorium: przygotowanie pracy zaliczeniowej

Podstawowe kryteria

W: uzyskanie na teście co najmniej 50% poprawnych odpowiedzi

L: ocena przygotowanych sprawozdań lub prezentacji multimedialnych

Przedmiot nie jest oferowany w żadnym z aktualnych cykli dydaktycznych.
Opisy przedmiotów w USOS i USOSweb są chronione prawem autorskim.
Właścicielem praw autorskich jest Uniwersytet Opolski.
pl. Kopernika 11a, 45-040 Opole https://uni.opole.pl kontakt deklaracja dostępności USOSweb 7.0.3.0-www6-1 (2024-04-02)