Print syllabus(in Polish) Wybrane zagadnienia z systematyki organizmów
General data
| Course ID: | 6.18-WZSO |
| Erasmus code / ISCED: | (unknown) / (unknown) |
| Course title: | (unknown) |
| Name in Polish: | Wybrane zagadnienia z systematyki organizmów |
| Organizational unit: | Faculty of Natural Sciences and Technology |
| Course groups: | |
| ECTS credit allocation (and other scores): |
(not available)
|
| Language: | (unknown) |
| Short description: |
(in Polish) (1) Rozumienie wybranych zagadnień dotyczących teorii i praktyki nazewnictwa i klasyfikowania biologicznego, oraz zasad podziału organizmów żywych. (2) Poznanie i zrozumienie pojęć z zakresu klasyfikacji organizmów; poznanie metod rekonstrukcji filogenezy. Umiejętność wartościowania i analizy cech użytych do tworzenia hipotez filogenetycznych. Zrozumienie metod filogenetyki klasycznej i molekularnej. Umiejętność wykorzystania technik komputerowych oraz danych internetowych w procesie rekonstrukcji filogenezy. Umiejętność prezentacji pracy semestralnej w postaci pokazu multimedialnego. (3) Nabycie wiedzy o nowoczesnej aparaturze badawczej, jej możliwościach i zastosowaniach w naukach przyrodniczych. Umiejętność pracy w grupie. |
| Full description: |
(in Polish) Problematyka wykładu: (1) Rola i zadania systematyki (taksonomii). Systematyka jako dziedzina nauk przyrodniczych. Historia powstania obecnej klasyfikacji organizmów. Zasady i stosowanie nomenklatury botanicznej i zoologicznej. Źródła danych i sposoby ich interpretacji w taksonomii. Metodyka badań taksonomicznych. Analiza filogenetyczna jako podstawa do tworzenia klasyfikacji. Podstawy systematyki fenetycznej, kladystycznej i ewolucyjnej. Taksonomia molekularna (2) Taksonomia i jej typy: klasyczna, fenetyczna, ewolucyjna, filogenetyczna i molekularna. Cechy w klasyfikacji, homologia i homoplazja; znaczenie tych zjawisk dla tworzenia klasyfikacji i rekonstrukcji filogenezy. Zastosowanie metod klasycznych i molekularnych w analizach filogenetycznych. Techniki analiz filogenetycznych – algorytmy, kryteria, tworzenie drzew oraz ich testowanie. Zastosowanie technik komputerowych do rekonstrukcji filogenezy. Wykorzystanie banków danych genetycznych w procesie rekonstrukcji filogenezy. Zegar molekularny i dane kopalne w rekonstrukcji filogenezy. Analizy filogenetyczne w oparciu o dane morfologiczne i molekularne na wybranych przykładach. (3) Mikroskopia świetlna i elektronowa, katodoluminescencja, mikrosondy, rentgenografia (XRD, XRF, tomografia), ultrafiolet, podczerwień, magnetyczny rezonans jądrowy, geochemia izotopów. Problematyka ćwiczeń laboratoryjnych: praktyczne zapoznanie się z aparaturą, analiza wyników |
| Bibliography: |
(in Polish) A. Literatura wymagana do ostatecznego zaliczenia zajęć: Futuyma, D. J.: Drzewo życia: klasyfikacja i filogeneza, str. 17-41, W: Ewolucja, Wydawnictwo UW, 2009. Matile L., Tassay P., Goujet D.: Wstęp do systematyki zoologicznej. PWN, Warszawa 1993, Spalik, K., M. Piwczyński: Rekonstrukcja filogenezy i wnioskowanie filogenetyczne w badaniach ewolucyjnych, Kosmos, 58(3/4): 485-498, 2009. Stace C. A.: Taksonomia roslin i biosystematyka. PWN, Warszawa 1993. Matile L., Tassy P., Goujet D. Wstęp do systematyki zoologicznej – koncepcje, zasady, metody. Wyd. Nauk. PWN,1993. Xiong J. Podstawy bioinformatyki. Wyd. UW, 2009 (przekład red. nauk. Bujnicki J.) Wägele J.-W. Foundations of Phylogenetic Systematics. Verlag Dr. Friedrich Pfeil, München, 2005. Pilot M., Rutkowski R. Zastosowanie metod molekularnych w badaniach ekologicznych. Muzeum i Instytut Zoologii PAN, Warszawa 2005. Brown T.A. Genomy. Wyd. Nauk. PWN, Warszawa, 2009. -literatura fachowa (publikacje) w języku polskim i angielskim. Artykuły naukowe z zakresu zastosowania omawianych metod fizyko-chemicznych B. Literatura uzupełniająca Higgs P.G., Attwood T.K. Bioinformatyka i ewolucja molekularna. Wyd. Nauk. PWN, Warszawa, 2008. Wheeler Q.D. (ed.). The New Taxonomy. CRC Press, Boca Raton – London – New York, 2008. Freeland J.R. Ekologia molekularna. Wydawnictwo Naukowe PWN, Warszawa, 2008. Słomski R. (red.). Przykłady analiz DNA. Wydawnictwo AR w Poznaniu, Poznań, 2004. literatura fachowa (publikacje) w języku polskim i angielskim. |
| Learning outcomes: |
(in Polish) Wiedza SD_W02_ opisuje wyspecjalizowane zagadnienia z zakresu biologii, bioinformatyki i ekologii SD_W03_dyskutuje na temat bieżących problemów naukowych z zakresu nauk biologicznych oraz ich powiązań z naukami ścisłymi i technicznymi. SD_W04_ charakteryzuje nowoczesną metodologię i warsztat badawczy uprawianej dyscypliny SD_W05_posługuje się specjalistyczną terminologią w języku ojczystym i kongresowym Umiejętności SD_U01_formułuje hipotezy badawcze i weryfikuje je za pomocą odpowiednio dobranych metod obliczeniowych SD_U03_wykorzystuje i analizuje różnorodne źródła specjalistycznej informacji, w tym bioinformatyczne Kompetencje społeczne (postawy) SD_K01_ dzieli się zdobytymi doświadczeniami w pracy naukowej i dydaktycznej SD_K02_krytycznie ocenia wyniki własnych badań i innych autorów |
| Assessment methods and assessment criteria: |
(in Polish) Sposób zaliczenia • wykład: egzamin/kolokwium • laboratorium: zaliczenie z oceną Formy zaliczenia • wykład: zaliczenie w formie pisemnego testu (test wyboru oraz z pytaniami otwartymi) • laboratorium: przygotowanie pracy zaliczeniowej Podstawowe kryteria W: uzyskanie na teście co najmniej 50% poprawnych odpowiedzi L: ocena przygotowanych sprawozdań lub prezentacji multimedialnych |
Copyright by University of Opole.
