Bioinformatyka
Informacje ogólne
| Kod przedmiotu: | 6.15.BTI-BI |
| Kod Erasmus / ISCED: |
13.4
|
| Nazwa przedmiotu: | Bioinformatyka |
| Jednostka: | Instytut Inżynierii Środowiska i Biotechnologii |
| Grupy: |
Plan zajęć III rok Biotechnologia inżynierska, I stopnia stacjonarne, semestr 06 (2025/26-L) |
| Punkty ECTS i inne: |
2.00
|
| Język prowadzenia: | polski |
| Rodzaj przedmiotu: | obowiązkowe |
| Tryb prowadzenia: | Realizowany zdalnie |
| Literatura uzupełniająca: | • A.D. Baxevanis, B.F.F. Ouellette (red.) Bioinformatics: A Practical Guide to the Analysis of Genes and Proteins. Wiley-Liss, Inc. 2005 (lub wersja tłumaczona na język polski wydana przez PWN, 2004) • Informacje dostępne na stronach internetowych baz danych i stronach związanych z genomiką i bioinformatyką. |
| Skrócony opis: |
Poznanie podstawowych zagadnień z dziedziny bioinformatyki oraz wiązanych z nimi baz danych. Zrozumienie metod komputerowych stosowanych w analizach sekwencji nukleotydowych. |
| Pełny opis: |
Poznanie podstawowych zagadnień z dziedziny bioinformatyki oraz wiązanych z nimi baz danych. Zrozumienie idei algorytmów i metod komputerowych stosowanych w analizach sekwencji nukleotydowych. Identyfikowanie sekwencji kodujących białko i analizy sekwencji RNA; poznanie podstaw transkryptomiki. Poznanie algorytmów i metod komputerowej analizy sekwencji białkowych. Zastosowanie biblioteki BioPython w analizie sekwencji genetycznych. |
| Literatura: |
• P.G. Higgs, T.K. Attwood. Bioinformatyka i ewolucja molekularna, PWN, 2008. • J.-M. Claverie, C. Notredame. Bioinformatics For Dummies. Wiley Publishing, Inc. 2006. |
| Efekty uczenia się: |
EUW1 Wie, na czym polegają analizy genomowe i mikromacierzowe oraz przewidywanie struktur cząsteczek EUW2 Rozumie teoretyczne i praktyczne podstawy analiz bioinformatycznych na różnychpoziomach organizacji informacji biologicznej: DNA, RNA i białek oraz genomów. EUW3 Student zna podstawowe i specjalistyczne bazy danych dotyczące genów, białek i genomów. Umiejętności EUU1 Potrafi zaplanować analizy bioinformatyczne i dobrać odpowiednie programy do postawionego problemu. EUU2 Student potrafi korzystać z biologicznych baz danych oraz obsługiwać podstawowe ispecjalistyczne programy i narzędzia bioinformatyczne analizujące sekwencje DNA,x`x RNA, białek, poszukujące sekwencji podobnych, wykonujące przyrównania sekwencji, przewidujące struktury i wykonujące analizy genomowe. EUU3 Student właściwie interpretuje uzyskane wyniki tych analiz. Kompetencje społeczne (postawy) EUK1 Student jest chętny do poszerzania swojej wiedzy przez poszukiwanie dodatkowych narzędzi bioinformatycznych w internecie oraz jest świadomy potrzeby ciągłego aktualizowania wiedzy w szybko rozwijającej się dziedzinie bioinformatyki. EUK2 Student potrafi pracować w grupie przyjmując w niej różne role |
| Metody i kryteria oceniania: |
ustna odpowiedź na pytania |
| Praktyki zawodowe: |
nie przewidziano |
Zajęcia w cyklu "Semestr letni 2024/2025" (w trakcie)
| Okres: | 2025-03-01 - 2025-09-30 |
 
PN WT ŚR LAB
CZ PT |
| Typ zajęć: |
Laboratorium, 30 godzin
|
|
| Koordynatorzy: | Grzegorz Kosior | |
| Prowadzący grup: | Grzegorz Kosior | |
| Lista studentów: | (nie masz dostępu) | |
| Zaliczenie: |
Przedmiot -
Zaliczenie na ocenę
Laboratorium - Zaliczenie na ocenę |
Zajęcia w cyklu "Semestr letni 2025/2026" (jeszcze nie rozpoczęty)
| Okres: | 2026-03-01 - 2026-09-30 |
PN WT ŚR CZ PT |
| Typ zajęć: |
Laboratorium, 30 godzin
|
|
| Koordynatorzy: | Grzegorz Kosior | |
| Prowadzący grup: | Grzegorz Kosior | |
| Lista studentów: | (nie masz dostępu) | |
| Zaliczenie: |
Przedmiot -
Zaliczenie na ocenę
Laboratorium - Zaliczenie na ocenę |
Właścicielem praw autorskich jest Uniwersytet Opolski.
