Biologia molekularna

obowiązkowe

Realizowany w sali
Realizowany zdalnie

1. Lewandowska Ronnegren A. Techniki laboratoryjne w biologii molekularnej. MedPharm, 2018.

2. Słomski R. (red.) Analiza DNA – teoria i praktyka. Wydawnictwo Uniwersytetu Przyrodniczego w Poznaniu, 2008.

Cele kształcenia

Poznanie podstawowych pojęć w biologii molekularnej.

Zrozumienie mechanizmów powstania i ewolucji informacji genetycznej; procesów replikacji DNA, translacji, transkrypcji oraz mechanizmów naprawy i rekombinacji DNA.

Poznanie możliwości analiz cząsteczek kwasów nukleinowych oraz przewidywania ich struktur drugo- i trzeciorzędowych.

Poznanie możliwości wykorzystanie wiedzy o funkcjonowaniu genów do badania procesów biologicznych z zakresu ewolucji i ekologii, filogenetyki i biologii sądowej.

Nabycie umiejętności izolacji materiału genetycznego pochodzącego z różnych źródeł.

Nabycie umiejętności zaplanowania i przeprowadzenia reakcji PCR oraz przeanalizowania wyników sekwencjonowania DNA.

Nabycie umiejętności prowadzenia dokumentacji laboratoryjnej.

Wykształcenie umiejętności planowania, przeprowadzenia i analizy wyników doświadczeń z zakresu biologii molekularnej z zachowaniem odpowiedzialności za bezpieczeństwo, powierzany sprzęt oraz własną pracę.

Wykład

Podstawowe pojęcia w biologii molekularnej.

Powstanie i ewolucja informacji genetycznej. Świat RNA.

Ewolucja kodu genetycznego. Ewolucja sekwencji DNA i białek.

Rodzaje RNA, budowa i funkcje; analiza struktur pierwszorzędowych DNA i RNA.

Analizy struktur drugorzędowych RNA – podstawy.

Metody przewidywania struktur drugorzędowych i trzeciorzędowych RNA.

Genomika, proteomika, metabolomika i inne –omiki.

Markery molekularne. Barkoding DNA, mini-barkoding DNA.

Filogenetyka i taksonomia molekularna.

Ekologia molekularna; filogeografia.

Biologia molekularna genu; replikacja DNA; uszkodzenia, naprawa i rekombinacja DNA.

Transkrypcja u prokariontów i eukariontów i jej regulacja.

Laboratorium:

Izolacja genomowego DNA z komórki zwierzęcej.

Izolacja DNA z wymazu.

Reakcja PCR, jej planowanie, optymalizacja.

Projektowanie starterów do reakcji PCR.

Oznaczanie płci genetycznej przy pomocy reakcji PCR.

Wykrywanie oporności genotypowej metodą PCR (wykrywanie delecji 32 pz w genie CCR5 związaną z opornością na zakażenie wirusem HIV-1).

Elektroforeza DNA.

Oczyszczanie produktu reakcji PCR.

Metody analiz wyników sekwencjonowania DNA.

Prowadzenie dokumentacji laboratoryjnej.

Allison L.A. Podstawy biologii molekularnej. Wydawnictwo Uniwersytetu Warszawskiego 2009.

Brown T.A. Genomy. Wydawnictwo Naukowe PWN, 2009.

Lewandowska Ronnegren A. Techniki laboratoryjne w biologii molekularnej. MedPharm, 2018.

Słomski R. (red.) Analiza DNA – teoria i praktyka. Wydawnictwo Uniwersytetu Przyrodniczego w Poznaniu, 2008.

Turner P.C., McLennan A.G., Bates A.D., Biologia molekularna. Krótkie wykłady, M.R.H. White; PWN 2007.

EUW1 Ma wiedzę z zakresu podstawowych pojęć i terminów stosowanych w biologii molekularnej oraz zdaje sobie sprawę z możliwości wykorzystanie wiedzy o funkcjonowaniu genów w aspekcie praktycznym

EUW2 Zna mechanizmy powstania i ewolucji informacji genetycznej, kodu genetycznego oraz sekwencji DNA i białek

EUW3 Ma wiedzę w zakresie procesów replikacji DNA, translacji, transkrypcji oraz mechanizmów naprawy i rekombinacji DNA

EUW4 Zna podstawy analiz cząsteczek kwasów nukleinowych i białek oraz przewidywania ich struktur drugorzędowych i trzeciorzędowych

EUU1 Potrafi zastosować podstawowe techniki i narzędzia stosowane w badaniach DNA, RNA i białek

EUU2 Posiada umiejętność izolacji materiału genetycznego, zaplanowania i przeprowadzenia reakcji PCR oraz przeanalizowania wyników sekwencjonowania DNA

EUU3 Potrafi pracując w zespole pod kierunkiem opiekuna wykonać określone zadania badawcze, prowadzić obserwacje i pomiary, interpretować wyniki i wyciągać wnioski

EUK1 Potrafi współdziałać i pracować w grupie, ma świadomość odpowiedzialności za wspólne realizowanie zadania badawcze, za bezpieczeństwo pracy własnej i innych

wykład:

Wykład: pisemny test zaliczeniowy (test wyboru oraz z pytaniami otwartymi), uzyskanie na teście 50% + 1 punktów, czyli udzielenie ponad połowę poprawnych odpowiedzi

Laboratorium:

Kolokwium zaliczeniowe – uzyskanie 51% punktów [40% oceny końcowej];

Przygotowanie sprawozdań (kart pracy) z realizowanych ćwiczeń [50% oceny końcowej];

Aktywność na zajęciach [10% oceny końcowej].